Beim Borneo-Zwergelefanten handelt es sich um einen zwergwüchsigen Verwandten des asiatischen Elefanten. Mit einer Schulterhöhe von rund 2,50 m ist er wesentlich kleiner als die anderen Unterarten seines nächsten Verwandten. Dabei sind die Tiere oft außergewöhnlich zahm und sanftmütig, wodurch sie von vielen Wissenschaftlern für Nachfahren von domestizierten Elefanten gehalten werden. Durch die Isolation und die daraus hervorgehende Inselverzwergung, die mit einer Domestizierung einhergehen würden, erklären sich viele Forscher den Grund für die im Verhältnis zum Körper groß gewachsenen Ohren. Auch vergleichsweise lange Schwänze und relativ große Stoßzähne zählen zu den häufigsten Merkmalen der Borneo-Zwergelefanten.
Ihr übriger Körper unterscheidet sich kaum von dem ihrer Verwandten. Die grau gefärbten Tieren besitzen einen langen Rüssel, mit dem sie sich waschen, nach Dingen greifen und ihre Nahrung pflücken. Ihre Augen sind relativ klein und sitzen seitlich in ihrem großen Schädel. An den Füßen befinden sich die für Elefanten üblichen Zehen.
Gemäß ihrem Namen leben die Borneo-Zwergelefanten ausschließlich in Borneo. Woher sie allerdings kommen, ist eine weit umstrittene Frage. Vor rund 18.000 Jahren schmolz der Eisschild der letzten Kaltzeit, welcher die Wassermassen der Weltmeere miteinander verband. Dadurch verschwanden verschiedene Landbrücken, die Borneo mit anderen Inseln und dem Festland verbunden hatten. Forscher vermuten daher, dass die Zwergelefanten entweder eingewandert sind oder es sich dabei wie erwähnt um eine importierte Form von Nachkommen einst domestizierter Elefanten handelt. Allerdings müsste diese Domestizierung auf das 16. bis 17. Jahrhundert zurückgehen. Eine nächste Verwandtschaft wird zu den Java-Elefanten vermutet.
Da der hauptsächliche Lebensraum (die Tieflandwälder in Borneo) großflächig abgeholzt wird, gelten die Borneo Elefanten als stark vom Aussterben bedroht.
Ihre Nahrung besteht insbesondere aus Gras, Baumrinde, Wurzeln und Blätter. Wenn es ihnen möglich ist, bedienen sie sich allerdings auch an Reis, Bananen und Rohrzucker.
Pro Tag nehmen die Borneo-Elefanten rund 150 kg Nahrung auf. Zudem benötigen sie einen täglichen Zugang zum Wasser, um dort zu trinken und sich zu waschen. Daher halten sich die Zwergelefanten stets in der Nähe von Wasserquellen auf.
Wie auch ihre nächsten Verwandten bringen die Kühe der Borneo-Elefanten etwa alle vier Jahre ein Kalb zur Welt. Besonders ist dabei, dass ab einem gewissen Alter die Fruchtbarkeit endet. Borneo-Elefanten können ab einem Alter von rund 40 Jahren keine Jungtiere mehr bekommen.